המנהל ישלח התראה מינהלית במקום הודעה על כוונת חיוב בהתקיים אחד או יותר מאלה:

(1) הוראה חדשה – ההפרה היא הפרת חובה חדשה או איסור חדש שנקבעו בפקודת המכס או בתקנות שהותקנו מכוחה ובלבד שטרם ניתנה למפר התראה לגביה; לעניין זה "חובה חדשה" או "איסור חדש" – חובה או איסור שלא חלפו שלושה חודשים ממועד כניסתם לתוקף.

(2) שינוי מדיניות אכיפה לחומרה – ההפרה שבוצעה היא הפרה של הוראה שביחס אליה פירסם המנהל הודעה גלויה לציבור על שינוי מדיניות האכיפה לחומרה ובלבד שטרם ניתנה למפר התראה לגביה; בהודעה כאמור, יצוין פרק הזמן בו תישלח התראה מינהלית בגין הפרה לגביה נעשה שינוי מדיניות אכיפה כאמור. הודעות בהתאם לנוהל זה יפורסמו באתר האינטרנט של רשות המיסים.

(3) הפסקת הפרה – בהפרות הנוגעות להצהרת יבוא, המפר הפסיק את ההפרה מיוזמתו, דיווח עליה למנהל, וככל  שההפרה האמורה גרמה להפרש במסי יבוא – ההפרש שולם במלואו, ובלבד שהדיווח למנהל בוצע לאחר שניתנה התרה לגבי הטובין הכלולים בהצהרת היבוא אליה מתייחסת ההפרה  ולא נפתחה חקירה או ביקורת או בדיקה בנוגע להפרה האמורה לפני הדיווח עליה.