המנהל רשאי, באישור שר הבריאות, להתקין תקנות לענינים אלה:
(1) ארגונו, נהליו ועיסוקיו של שירות ההסגר;
(2) תפקידיהם וחובותיהם של פקידי שירות ההסגר;
(3) מקומות ואופן לכניסת כלי טיס, כלי שיט וכלי רכב, ליציאתם, לעליה אליהם ולירידה מהם, ולכניסת בני אדם וליציאתם;
(4) בדיקה, חיטוי ועיכוב של כלי טיס, כלי שיט, כלי רכב ובני אדם המגיעים או עוזבים בדרך הים, היבשה או האויר, ובקורת על תנועותיהם;
(5) האגרות שיש לשלמן בעד שירותי הסגר או בקשר עמם;
(6) הקנסות שיוטלו על כלי רכב, כלי שיט וכלי טיס בשל הפרת התקנות;
(7) כל ענין הנדון באמנת בריאות או תברואה בינלאומית שבתוקף אותה שעה;
(8) המניעה, בדרך כלל, של חדירת מגפות לישראל או העברתן ממנה.